Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL1P22362 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL1P22362 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCL1P22362 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL1P22362 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL1P22362 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL1P22362 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL1P22362 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL1P22362 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL1P22362 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL1P22362 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL1P22362 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL1P22362 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL1P22362 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL1P22362 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL1P22362 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL1P22362 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL1P22362 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL1P22362 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL1P22362 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL1P22362 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL1P22362 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL1P22362 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL1P22362 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL1P22362 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL1P22362 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL1P22362 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL1P22362 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms