Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH3P22223 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH3P22223 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH3P22223 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH3P22223 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH3P22223 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH3P22223 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH3P22223 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH3P22223 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH3P22223 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH3P22223 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH3P22223 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH3P22223 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH3P22223 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH3P22223 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH3P22223 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH3P22223 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH3P22223 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH3P22223 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH3P22223 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH3P22223 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH3P22223 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH3P22223 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH3P22223 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH3P22223 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH3P22223 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH3P22223 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH3P22223 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH3P22223 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH3P22223 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH3P22223 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH3P22223 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH3P22223 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH3P22223 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH3P22223 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH3P22223 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH3P22223 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms