Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A1P20849 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A1P20849 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A1P20849 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms