Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTF3P20783 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTF3P20783 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTF3P20783 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTF3P20783 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTF3P20783 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTF3P20783 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTF3P20783 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTF3P20783 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTF3P20783 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTF3P20783 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF3P20783 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF3P20783 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms