Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA5P20719 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms