Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSMB1P20618 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB1P20618 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms