Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CD53P19397 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD53P19397 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD53P19397 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD53P19397 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD53P19397 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD53P19397 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD53P19397 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD53P19397 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD53P19397 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD53P19397 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD53P19397 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD53P19397 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD53P19397 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD53P19397 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CD53P19397 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD53P19397 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD53P19397 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD53P19397 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD53P19397 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD53P19397 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD53P19397 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD53P19397 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD53P19397 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms