Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCLP19338 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCLP19338 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCLP19338 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCLP19338 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCLP19338 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCLP19338 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCLP19338 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCLP19338 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCLP19338 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCLP19338 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCLP19338 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCLP19338 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCLP19338 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCLP19338 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCLP19338 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCLP19338 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCLP19338 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCLP19338 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCLP19338 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCLP19338 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCLP19338 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCLP19338 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCLP19338 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCLP19338 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCLP19338 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCLP19338 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCLP19338 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCLP19338 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCLP19338 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCLP19338 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCLP19338 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCLP19338 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCLP19338 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCLP19338 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCLP19338 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCLP19338 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCLP19338 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCLP19338 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCLP19338 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCLP19338 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCLP19338 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCLP19338 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCLP19338 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCLP19338 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCLP19338 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCLP19338 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCLP19338 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCLP19338 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCLP19338 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCLP19338 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCLP19338 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCLP19338 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCLP19338 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCLP19338 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCLP19338 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCLP19338 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCLP19338 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCLP19338 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCLP19338 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCLP19338 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCLP19338 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCLP19338 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCLP19338 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCLP19338 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCLP19338 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCLP19338 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms