Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XRCC1P18887 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms