Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMPD1P17405 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMPD1P17405 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD1P17405 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms