Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOLR1P15328 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR1P15328 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms