Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB2P14652 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB2P14652 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB2P14652 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB2P14652 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms