Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS3P13797 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS3P13797 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS3P13797 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS3P13797 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS3P13797 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLS3P13797 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLS3P13797 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLS3P13797 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLS3P13797 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLS3P13797 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLS3P13797 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLS3P13797 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLS3P13797 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLS3P13797 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLS3P13797 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLS3P13797 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLS3P13797 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLS3P13797 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLS3P13797 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLS3P13797 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLS3P13797 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLS3P13797 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLS3P13797 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLS3P13797 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLS3P13797 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLS3P13797 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLS3P13797 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLS3P13797 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLS3P13797 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLS3P13797 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLS3P13797 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLS3P13797 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLS3P13797 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLS3P13797 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLS3P13797 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLS3P13797 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLS3P13797 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PLS3P13797 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLS3P13797 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLS3P13797 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLS3P13797 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLS3P13797 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLS3P13797 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLS3P13797 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLS3P13797 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLS3P13797 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLS3P13797 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLS3P13797 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLS3P13797 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLS3P13797 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLS3P13797 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PLS3P13797 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLS3P13797 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLS3P13797 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLS3P13797 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms