Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP1A3P13637 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A3P13637 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP1A3P13637 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms