Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFTRP13569 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFTRP13569 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFTRP13569 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CFTRP13569 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFTRP13569 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFTRP13569 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFTRP13569 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFTRP13569 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFTRP13569 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CFTRP13569 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CFTRP13569 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CFTRP13569 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CFTRP13569 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CFTRP13569 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CFTRP13569 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
CFTRP13569 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CFTRP13569 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFTRP13569 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFTRP13569 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFTRP13569 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CFTRP13569 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CFTRP13569 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
CFTRP13569 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CFTRP13569 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CFTRP13569 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFTRP13569 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFTRP13569 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFTRP13569 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFTRP13569 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFTRP13569 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CFTRP13569 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CFTRP13569 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CFTRP13569 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CFTRP13569 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CFTRP13569 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CFTRP13569 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CFTRP13569 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CFTRP13569 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CFTRP13569 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CFTRP13569 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CFTRP13569 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CFTRP13569 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CFTRP13569 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CFTRP13569 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
CFTRP13569 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CFTRP13569 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CFTRP13569 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CFTRP13569 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CFTRP13569 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CFTRP13569 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CFTRP13569 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CFTRP13569 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CFTRP13569 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFTRP13569 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFTRP13569 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFTRP13569 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFTRP13569 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CFTRP13569 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CFTRP13569 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CFTRP13569 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CFTRP13569 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CFTRP13569 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CFTRP13569 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFTRP13569 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFTRP13569 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFTRP13569 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFTRP13569 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CFTRP13569 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CFTRP13569 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CFTRP13569 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CFTRP13569 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CFTRP13569 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CFTRP13569 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CFTRP13569 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CFTRP13569 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CFTRP13569 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CFTRP13569 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CFTRP13569 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CFTRP13569 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFTRP13569 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFTRP13569 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFTRP13569 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFTRP13569 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFTRP13569 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms