Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GP1BBP13224 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GP1BBP13224 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms