Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEPDP12955 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PEPDP12955 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEPDP12955 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEPDP12955 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEPDP12955 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEPDP12955 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEPDP12955 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEPDP12955 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEPDP12955 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEPDP12955 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEPDP12955 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEPDP12955 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEPDP12955 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEPDP12955 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEPDP12955 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEPDP12955 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEPDP12955 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEPDP12955 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEPDP12955 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEPDP12955 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEPDP12955 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEPDP12955 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEPDP12955 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms