Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL11A1P12107 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COL11A1P12107 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL11A1P12107 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms