Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEFHP12036 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEFHP12036 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFHP12036 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEFHP12036 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFHP12036 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFHP12036 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFHP12036 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFHP12036 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFHP12036 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFHP12036 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFHP12036 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFHP12036 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFHP12036 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFHP12036 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFHP12036 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFHP12036 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFHP12036 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFHP12036 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFHP12036 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFHP12036 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFHP12036 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFHP12036 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFHP12036 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFHP12036 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFHP12036 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFHP12036 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms