Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRFP11831 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFP11831 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFP11831 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFP11831 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFP11831 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFP11831 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFP11831 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFP11831 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRFP11831 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRFP11831 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRFP11831 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFP11831 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRFP11831 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRFP11831 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRFP11831 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRFP11831 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFP11831 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFP11831 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFP11831 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFP11831 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFP11831 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFP11831 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFP11831 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFP11831 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFP11831 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFP11831 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFP11831 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFP11831 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFP11831 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFP11831 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFP11831 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFP11831 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFP11831 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFP11831 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFP11831 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFP11831 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFP11831 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFP11831 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFP11831 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFP11831 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFP11831 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFP11831 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFP11831 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFP11831 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFP11831 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFP11831 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFP11831 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFP11831 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms