Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VDRP11473 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VDRP11473 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VDRP11473 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VDRP11473 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VDRP11473 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VDRP11473 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VDRP11473 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VDRP11473 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VDRP11473 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VDRP11473 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VDRP11473 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VDRP11473 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VDRP11473 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VDRP11473 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VDRP11473 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VDRP11473 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VDRP11473 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VDRP11473 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VDRP11473 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VDRP11473 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VDRP11473 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VDRP11473 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VDRP11473 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VDRP11473 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VDRP11473 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VDRP11473 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VDRP11473 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VDRP11473 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VDRP11473 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VDRP11473 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VDRP11473 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VDRP11473 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VDRP11473 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VDRP11473 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VDRP11473 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VDRP11473 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VDRP11473 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VDRP11473 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VDRP11473 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VDRP11473 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VDRP11473 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDRP11473 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDRP11473 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDRP11473 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDRP11473 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDRP11473 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDRP11473 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VDRP11473 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
VDRP11473 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VDRP11473 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VDRP11473 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VDRP11473 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VDRP11473 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VDRP11473 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VDRP11473 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VDRP11473 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VDRP11473 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VDRP11473 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VDRP11473 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VDRP11473 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDRP11473 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDRP11473 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDRP11473 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDRP11473 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VDRP11473 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms