Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRAP10827 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRAP10827 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THRAP10827 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THRAP10827 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THRAP10827 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THRAP10827 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THRAP10827 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THRAP10827 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THRAP10827 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP10827 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP10827 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP10827 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP10827 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP10827 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THRAP10827 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
THRAP10827 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THRAP10827 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms