Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GLI3P10071 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GLI3P10071 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GLI3P10071 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GLI3P10071 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GLI3P10071 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GLI3P10071 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GLI3P10071 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GLI3P10071 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GLI3P10071 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GLI3P10071 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GLI3P10071 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
GLI3P10071 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
GLI3P10071 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
GLI3P10071 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
GLI3P10071 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GLI3P10071 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GLI3P10071 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GLI3P10071 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GLI3P10071 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GLI3P10071 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GLI3P10071 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GLI3P10071 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GLI3P10071 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GLI3P10071 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GLI3P10071 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GLI3P10071 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GLI3P10071 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GLI3P10071 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GLI3P10071 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GLI3P10071 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GLI3P10071 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GLI3P10071 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GLI3P10071 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GLI3P10071 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GLI3P10071 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GLI3P10071 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GLI3P10071 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GLI3P10071 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GLI3P10071 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GLI3P10071 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
GLI3P10071 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GLI3P10071 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GLI3P10071 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GLI3P10071 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GLI3P10071 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GLI3P10071 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GLI3P10071 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GLI3P10071 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GLI3P10071 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
GLI3P10071 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GLI3P10071 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GLI3P10071 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GLI3P10071 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GLI3P10071 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GLI3P10071 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GLI3P10071 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GLI3P10071 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GLI3P10071 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GLI3P10071 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GLI3P10071 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GLI3P10071 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.5 ms