Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM17P0DL12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM17P0DL12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms