Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIMD1P0DJR0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMD1P0DJR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms