Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM6P0DI80 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM6P0DI80 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms