Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CT47B1P0C2W7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CT47B1P0C2W7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CT47B1P0C2W7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CT47B1P0C2W7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CT47B1P0C2W7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CT47B1P0C2W7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CT47B1P0C2W7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CT47B1P0C2W7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CT47B1P0C2W7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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