Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTAP09496 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTAP09496 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTAP09496 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTAP09496 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTAP09496 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTAP09496 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTAP09496 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLTAP09496 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTAP09496 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLTAP09496 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLTAP09496 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLTAP09496 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTAP09496 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTAP09496 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLTAP09496 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLTAP09496 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTAP09496 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTAP09496 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLTAP09496 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTAP09496 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTAP09496 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLTAP09496 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLTAP09496 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms