Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFICP08651 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFICP08651 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFICP08651 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFICP08651 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFICP08651 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFICP08651 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFICP08651 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFICP08651 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFICP08651 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFICP08651 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFICP08651 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFICP08651 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFICP08651 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFICP08651 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFICP08651 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFICP08651 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFICP08651 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFICP08651 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFICP08651 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFICP08651 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFICP08651 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFICP08651 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFICP08651 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFICP08651 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFICP08651 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFICP08651 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFICP08651 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFICP08651 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFICP08651 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFICP08651 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFICP08651 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFICP08651 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFICP08651 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFICP08651 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFICP08651 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFICP08651 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFICP08651 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFICP08651 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFICP08651 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFICP08651 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFICP08651 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFICP08651 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFICP08651 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFICP08651 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms