Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRAP08240 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPRAP08240 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRAP08240 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms