Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP1P08047 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SP1P08047 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SP1P08047 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SP1P08047 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SP1P08047 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP1P08047 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP1P08047 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP1P08047 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP1P08047 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP1P08047 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SP1P08047 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SP1P08047 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP1P08047 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP1P08047 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP1P08047 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP1P08047 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP1P08047 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SP1P08047 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP1P08047 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP1P08047 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SP1P08047 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SP1P08047 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SP1P08047 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SP1P08047 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SP1P08047 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SP1P08047 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms