Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSLP07711 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSLP07711 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSLP07711 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSLP07711 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSLP07711 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSLP07711 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSLP07711 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSLP07711 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSLP07711 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSLP07711 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSLP07711 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSLP07711 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSLP07711 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSLP07711 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSLP07711 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSLP07711 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSLP07711 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSLP07711 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSLP07711 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSLP07711 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSLP07711 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSLP07711 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSLP07711 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSLP07711 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSLP07711 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSLP07711 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSLP07711 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSLP07711 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSLP07711 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSLP07711 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSLP07711 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSLP07711 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSLP07711 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSLP07711 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSLP07711 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSLP07711 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSLP07711 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSLP07711 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSLP07711 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms