Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF1RP07333 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CSF1RP07333 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF1RP07333 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF1RP07333 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms