Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFMP07197 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFMP07197 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFMP07197 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFMP07197 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFMP07197 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFMP07197 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFMP07197 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFMP07197 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFMP07197 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFMP07197 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFMP07197 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFMP07197 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFMP07197 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFMP07197 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFMP07197 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFMP07197 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFMP07197 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFMP07197 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFMP07197 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NEFMP07197 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NEFMP07197 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NEFMP07197 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFMP07197 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFMP07197 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFMP07197 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFMP07197 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFMP07197 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFMP07197 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFMP07197 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEFMP07197 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEFMP07197 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEFMP07197 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEFMP07197 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFMP07197 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFMP07197 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFMP07197 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFMP07197 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFMP07197 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFMP07197 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFMP07197 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFMP07197 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFMP07197 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFMP07197 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFMP07197 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFMP07197 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEFMP07197 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEFMP07197 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFMP07197 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFMP07197 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFMP07197 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFMP07197 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFMP07197 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFMP07197 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFMP07197 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFMP07197 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFMP07197 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFMP07197 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFMP07197 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFMP07197 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFMP07197 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFMP07197 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFMP07197 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFMP07197 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFMP07197 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFMP07197 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFMP07197 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFMP07197 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEFMP07197 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NEFMP07197 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFMP07197 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms