Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF4EP06730 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF4EP06730 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF4EP06730 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF4EP06730 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF4EP06730 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EP06730 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms