Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOA4P06727 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOA4P06727 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOA4P06727 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA4P06727 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA4P06727 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA4P06727 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA4P06727 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA4P06727 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA4P06727 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA4P06727 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA4P06727 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOA4P06727 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APOA4P06727 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APOA4P06727 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA4P06727 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA4P06727 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA4P06727 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA4P06727 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA4P06727 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA4P06727 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOA4P06727 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOA4P06727 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA4P06727 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOA4P06727 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA4P06727 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA4P06727 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA4P06727 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA4P06727 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms