Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYL1P05976 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYL1P05976 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYL1P05976 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYL1P05976 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYL1P05976 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL1P05976 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL1P05976 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL1P05976 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL1P05976 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYL1P05976 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYL1P05976 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYL1P05976 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYL1P05976 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL1P05976 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL1P05976 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL1P05976 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL1P05976 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL1P05976 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL1P05976 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYL1P05976 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL1P05976 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL1P05976 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL1P05976 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL1P05976 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL1P05976 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL1P05976 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL1P05976 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL1P05976 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYL1P05976 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYL1P05976 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL1P05976 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL1P05976 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL1P05976 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL1P05976 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYL1P05976 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYL1P05976 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYL1P05976 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MYL1P05976 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYL1P05976 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms