Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB1P05556 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB1P05556 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB1P05556 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms