Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTNP04004 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTNP04004 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTNP04004 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTNP04004 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTNP04004 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTNP04004 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTNP04004 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTNP04004 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTNP04004 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTNP04004 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTNP04004 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTNP04004 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTNP04004 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTNP04004 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTNP04004 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTNP04004 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTNP04004 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VTNP04004 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTNP04004 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTNP04004 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTNP04004 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTNP04004 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTNP04004 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTNP04004 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTNP04004 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VTNP04004 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTNP04004 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTNP04004 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTNP04004 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTNP04004 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTNP04004 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTNP04004 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTNP04004 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTNP04004 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTNP04004 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTNP04004 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTNP04004 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTNP04004 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTNP04004 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms