Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGAP02671 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGAP02671 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGAP02671 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGAP02671 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGAP02671 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGAP02671 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGAP02671 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGAP02671 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGAP02671 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGAP02671 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGAP02671 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGAP02671 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGAP02671 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGAP02671 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGAP02671 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FGAP02671 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGAP02671 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGAP02671 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGAP02671 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGAP02671 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGAP02671 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FGAP02671 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGAP02671 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGAP02671 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGAP02671 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGAP02671 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGAP02671 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGAP02671 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGAP02671 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGAP02671 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGAP02671 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGAP02671 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGAP02671 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGAP02671 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGAP02671 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGAP02671 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGAP02671 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGAP02671 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FGAP02671 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FGAP02671 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGAP02671 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGAP02671 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGAP02671 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGAP02671 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGAP02671 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGAP02671 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGAP02671 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FGAP02671 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGAP02671 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGAP02671 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGAP02671 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGAP02671 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGAP02671 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGAP02671 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGAP02671 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGAP02671 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGAP02671 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGAP02671 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FGAP02671 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGAP02671 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGAP02671 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGAP02671 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGAP02671 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGAP02671 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGAP02671 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGAP02671 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGAP02671 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FGAP02671 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGAP02671 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGAP02671 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGAP02671 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGAP02671 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGAP02671 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms