Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOEP02649 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOEP02649 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOEP02649 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOEP02649 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOEP02649 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOEP02649 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOEP02649 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOEP02649 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOEP02649 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOEP02649 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOEP02649 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOEP02649 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOEP02649 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOEP02649 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOEP02649 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOEP02649 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOEP02649 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOEP02649 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOEP02649 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOEP02649 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOEP02649 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOEP02649 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOEP02649 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOEP02649 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
APOEP02649 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOEP02649 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOEP02649 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOEP02649 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOEP02649 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOEP02649 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOEP02649 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOEP02649 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOEP02649 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOEP02649 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOEP02649 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOEP02649 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOEP02649 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOEP02649 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOEP02649 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOEP02649 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOEP02649 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOEP02649 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOEP02649 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOEP02649 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOEP02649 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOEP02649 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOEP02649 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOEP02649 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOEP02649 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOEP02649 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOEP02649 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOEP02649 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOEP02649 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOEP02649 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOEP02649 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOEP02649 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms