Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL2A1P02458 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL2A1P02458 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL2A1P02458 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL2A1P02458 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL2A1P02458 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL2A1P02458 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL2A1P02458 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL2A1P02458 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL2A1P02458 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms