Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1RP00736 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1RP00736 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1RP00736 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1RP00736 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1RP00736 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1RP00736 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1RP00736 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1RP00736 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1RP00736 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C1RP00736 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1RP00736 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1RP00736 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1RP00736 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C1RP00736 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1RP00736 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1RP00736 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1RP00736 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1RP00736 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1RP00736 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1RP00736 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1RP00736 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1RP00736 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1RP00736 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1RP00736 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1RP00736 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C1RP00736 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1RP00736 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1RP00736 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1RP00736 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1RP00736 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1RP00736 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1RP00736 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1RP00736 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1RP00736 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1RP00736 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1RP00736 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1RP00736 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1RP00736 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1RP00736 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1RP00736 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1RP00736 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1RP00736 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1RP00736 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1RP00736 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1RP00736 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1RP00736 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1RP00736 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1RP00736 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1RP00736 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1RP00736 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1RP00736 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1RP00736 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1RP00736 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1RP00736 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1RP00736 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1RP00736 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1RP00736 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1RP00736 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1RP00736 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1RP00736 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1RP00736 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1RP00736 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1RP00736 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1RP00736 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1RP00736 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1RP00736 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1RP00736 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1RP00736 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1RP00736 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1RP00736 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms