Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1PR4O95977 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR4O95977 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms