Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF4AO95239 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIF4AO95239 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIF4AO95239 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms