Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX4O95219 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX4O95219 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX4O95219 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX4O95219 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX4O95219 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX4O95219 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX4O95219 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX4O95219 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX4O95219 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX4O95219 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX4O95219 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX4O95219 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX4O95219 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX4O95219 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX4O95219 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX4O95219 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX4O95219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX4O95219 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX4O95219 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX4O95219 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX4O95219 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX4O95219 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX4O95219 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms