Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC31AO94979 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC31AO94979 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms