Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX3O75364 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX3O75364 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX3O75364 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX3O75364 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX3O75364 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX3O75364 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX3O75364 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX3O75364 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX3O75364 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX3O75364 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX3O75364 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX3O75364 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX3O75364 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX3O75364 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX3O75364 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX3O75364 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX3O75364 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX3O75364 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX3O75364 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX3O75364 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX3O75364 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX3O75364 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms