Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF40O75150 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF40O75150 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF40O75150 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF40O75150 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF40O75150 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF40O75150 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF40O75150 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF40O75150 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF40O75150 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF40O75150 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF40O75150 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF40O75150 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF40O75150 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF40O75150 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF40O75150 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF40O75150 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF40O75150 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF40O75150 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF40O75150 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF40O75150 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF40O75150 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF40O75150 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF40O75150 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF40O75150 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF40O75150 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms