Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF10O60809 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms